Также имеет место проблема с переполненностью существующих полигонов (включенных в реестр — 35), а также их отсутствие в некоторых районах. По словам Мирхайдара Фатхуллина, в регионе есть еще 15 полигонов, не включенных в реестр, их ведомство также рассматривает в качестве резерва. Необходимы и мусоросортировочные, мусороперегрузочные комплексы, предприятия по переработке отходов. В настоящее время в Башкортостане утверждена территориальная схема обращения, где описана вся система организации и осуществления деятельности по сбору, транспортированию, обработке, утилизации, обезвреживанию, захоронению отходов, образующихся на территории Башкирии. Ее
электронная модель доступна на сайте Министерства природопользования и экологии РБ.